巧克力囊腫可在宮腔鏡的窺視下看到子宮內膜樣組織，子宮內膜碎片每月脫落一次，形成月經。如月經期子宮壁脫落的子宮內膜碎片因引流不暢，不能全部從陰道排出，隨經血逆流經輸卵管進入盆腔，導致種植在卵巢表面或盆腔其他部位，形成異位囊腫。這種病初為小型囊腫，但拖延日久不重視治療，則每次月經來潮前後會腹痛劇烈，患者多因異位的子宮內膜組織，在卵巢激素的影響下，發生週期性充血、出血及剝脫等月經樣變化，故又稱它為“卵巢子宮內膜異位症”。尤於這種囊腫內滯留的陳舊血瘀如巧克力糊狀的顏色，故稱它為“巧克力囊腫”。
如果是在卵巢，就會影響到卵巢、輸卵管功能，造成不孕。
- 不正常的經痛、月經不調：為巧克力囊腫的主要症狀，同時也是最容易被忽略的症狀表現，87.7%的患者有痛經進行性加重的症狀，月經過多，月經血量多，為繼發性且逐年加重，但也有少數病人無明顯的痛經。
- 下腹痛：沒有其他的症狀，下腹疼痛占71.3%
- 性生活痛：由於子宮肌肉收縮，56.2%的人會有明顯的性交疼痛。患者還可能會出現滴狀的出血，而且常於月經前較為明顯。
- 患不孕症：巧克力囊腫會導致婦女不能懷孕，其不孕率達50.9%左右，在不孕症女性中，巧克力囊腫所造成的不孕佔有很高的比例。
卵巢巧克力囊腫的預防措施：
- 注意調整自己的情緒，保持樂觀開朗的心態，使機體免疫系統的功能正常。天天5蔬果增強，多吸收鐵質補充血紅素。
- 月經期間，禁止一切劇烈體育運動及重體力勞動。要注意自身保暖，避免感寒著涼。
- 如已查出患有子宮內膜異位症，巧克力囊腫大於6cm以上者，在月經期或月經中期一定要注 意保持情緒穩定，避免過度勞累，一旦囊腔內張力突然升高時，囊壁破裂，會形成急腹症。
- 女性月經期一定要禁止性生活，盡量少做人工流產和刮宮，做好計劃生育。
- 女孩子青春期要避免受驚嚇，以免導致閉經可形成溢流。
除了上述的預防措施以外，由於賀爾蒙是影響女性朋友情緒和健康的關鍵，我們可藉由經期前 後，可針對腰腹部進行內分泌調理按摩課程，以經絡疏通的方式達到調理氣血，改善內分泌循環，並可服用琉璃苣(含有自然界裡最高的GLA不飽和脂肪酸濃度)來平衡賀爾蒙，減緩發炎症 狀，以達到內服外調理，雙管齊下的方式有效預防女性子宮卵巢的問題 。